يهتم قسم أمراض القلب لدى الأطفال بدراسة التشوهات الخلقية القلبية، وأمراض القلب المكتسبة، والتشوهات في الدوران الجهازي والرئوي في الجنين، والمواليد، والأطفال، والشباب البالغين.